Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700016D06RikQ9DAA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016D06RikQ9DAA5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016D06RikQ9DAA5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms