Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem239Q9DA47 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms