Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D9S1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D9S1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9S1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms