Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg7Q9D906 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg7Q9D906 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg7Q9D906 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms