Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx5Q9D8U8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx5Q9D8U8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms