Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8L0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8L0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms