Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jam3Q9D8B7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jam3Q9D8B7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms