Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmigd1Q9D7L8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms