Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D7E4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D7E4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D7E4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms