Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra4Q9D6F4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms