Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt34Q9D646 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms