Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc81Q9D5W4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc81Q9D5W4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms