Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PudpQ9D5U5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms