Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms