Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrameQ9D4Z5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms