Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc83Q9D4V3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms