Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2al3Q9D4U4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms