Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
4933428G20RikQ9D3X4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms