Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4933428M09RikQ9D3X3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms