Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms