Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus10Q9D3U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pus10Q9D3U0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus10Q9D3U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms