Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx29Q9D3S3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms