Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt44Q9D2Q2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms