Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbcbQ9D1E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TbcbQ9D1E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbcbQ9D1E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms