Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1lQ9D1E5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms