Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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Hddc3Q9D114 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hddc3Q9D114 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Hddc3Q9D114 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Hddc3Q9D114 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc3Q9D114 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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