Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.4 ms