Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmss1Q9CZT6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmss1Q9CZT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms