Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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