Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl35Q9CZ49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl35Q9CZ49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms