Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp2Q9CYZ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms