Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx7Q9CY18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms