Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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