Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn3Q9CVD2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms