Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda2Q9CRC9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms