Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifitm3Q9CQW9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms