Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PompQ9CQT5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms