Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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