Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd5Q9CQP3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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