Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms