Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snrpb2Q9CQI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snrpb2Q9CQI7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpb2Q9CQI7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms