Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nudt21Q9CQF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nudt21Q9CQF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms