Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl11Q9CQF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl11Q9CQF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms