Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sar1bQ9CQC9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sar1bQ9CQC9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms