Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole4Q9CQ36 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pole4Q9CQ36 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms