Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
StambpQ9CQ26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms