Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc18Q9CQ07 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc18Q9CQ07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms