Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Commd4Q9CQ02 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Commd4Q9CQ02 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms