Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc198Q9CPZ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms