Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf8Q99PV0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms